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数控加工铝件与其他金属和铝合金材料时，对人体可能存在一定的危害，但具体危害程度与加工条件、个人防护措施等多种因素有关，主要的危害包括：
1、粉尘危害：在铝材切削过程中，会产生金属粉尘，长期吸入可能对人体的呼吸系统造成损害，引发疾病如尘肺病等。
2、噪音危害：数控机床运行时产生的噪音可能对人体听力造成损害，长期暴露于高噪音环境中可能导致听力下降、耳鸣等问题。
3、化学危害：某些情况下，铝材表面可能含有有害物质，如化学涂层等，加工过程中可能释放有害气体或微粒，对人体健康造成威胁。
至于数控加工金属和铝合金的选择，主要取决于具体的应用场景和材料特性，金属和铝合金在硬度、耐磨性、耐腐蚀性等方面存在差异，因此选择哪种材料取决于零件的使用要求和设计，某些高强度、高刚性的零件可能更适合使用金属材料，而一些对重量有严格要求的零件则可能更适合使用铝合金。
无论加工哪种材料，都需要采取相应的防护措施来保护工人的健康，这包括使用专业的防护设备、改善工作环境、定期健康检查等，合理安排工作时间，避免长时间连续工作，也有助于降低健康风险。